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發(fā)表于：2024/08/13 12:08:42
中新網(wǎng)深圳8月8日電 (記者 索有為)華大集團8日發(fā)布消息稱，瑞典烏普薩拉大學(xué)近日聯(lián)合華大集團旗下的華大生命科學(xué)研究院、華大基因智惠醫(yī)學(xué)研究院，對逾千例結(jié)直腸癌樣本進行了全基因組及轉(zhuǎn)錄組測序分析，發(fā)現(xiàn)了一系列與癌癥不同階段相關(guān)的基因，并識別了結(jié)直腸癌關(guān)鍵預(yù)后因子，為結(jié)直腸癌的預(yù)防、治療及預(yù)后提供了數(shù)據(jù)基礎(chǔ)，相關(guān)研究成果于8月7日發(fā)表于全球頂級學(xué)術(shù)期刊《自然》(Nature)，這也是目前全球最大的結(jié)直腸癌多組學(xué)研究。
據(jù)介紹，全球每年新增結(jié)直腸癌病例約190萬，結(jié)直腸癌發(fā)病率居所有癌癥第三位，約20%的患者在確診時已發(fā)生轉(zhuǎn)移，結(jié)直腸癌死亡率高居各類癌癥第二位。
該研究基于華大智造DNBSEQ測序平臺，對瑞典知名癌癥樣本與數(shù)據(jù)庫U-CAN隊列中的1063例結(jié)直腸癌樣本進行全基因組和轉(zhuǎn)錄組測序分析，鑒定得到了96個顯著突變基因，其中，有24個為新發(fā)現(xiàn)的潛在驅(qū)動基因，而與WNT, EGFR和TGF-β通路相關(guān)的驅(qū)動基因與結(jié)直腸癌生存顯著相關(guān)。不僅如此，研究人員還利用突變時序分析，推導(dǎo)出了9個與癌癥發(fā)生早期事件相關(guān)的驅(qū)動突變基因，和更傾向于在癌癥發(fā)生的后期階段出現(xiàn)的突變基因。這些發(fā)現(xiàn)為結(jié)直腸癌的早期檢測和靶向治療的開發(fā)提供了臨床研究策略，并揭示了與腫瘤后期侵襲和轉(zhuǎn)移相關(guān)的重要分子變化。
該研究中，研究人員通過全基因組和轉(zhuǎn)錄組測序分析發(fā)現(xiàn)在線粒體基因組和非編碼區(qū)域中也存在與疾病相關(guān)的突變，并對與疾病進展顯著相關(guān)的突變進行了系統(tǒng)性的總結(jié)，這些突破性的發(fā)現(xiàn)填補了非編碼區(qū)在結(jié)直腸癌相關(guān)研究中的空白，將進一步推動對結(jié)直腸癌發(fā)病機制的理解。
隨后，分析團隊利用同一腫瘤樣本的基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進行了整合分析，驗證了無論是否為微衛(wèi)星不穩(wěn)定腫瘤，其抑癌基因上的突變均導(dǎo)致基因表達降低，從而更容易患癌。進一步地，研究團隊基于腫瘤基因表達差異，將結(jié)直腸癌預(yù)后分為了5個預(yù)后亞型CRPS，相較于結(jié)直腸癌經(jīng)典的共識分子分型CMS，該研究構(gòu)建的CRPS能更加準確地預(yù)測預(yù)后。
文章通訊作者、烏普薩拉大學(xué)的Tobias Sjöblom教授表示，該研究實現(xiàn)了迄今為止最大規(guī)模的結(jié)直腸癌基因組和轉(zhuǎn)錄組的綜合分析，并將分子層面的發(fā)現(xiàn)與高質(zhì)量的臨床數(shù)據(jù)相結(jié)合，從而識別關(guān)鍵預(yù)后因子，這使這項研究有別于其他絕大多數(shù)癌癥基因組學(xué)的研究。
文章共同通訊作者、華大基因智惠醫(yī)學(xué)研究院林從博士表示，此次通過將華大先進的基因組學(xué)技術(shù)和數(shù)據(jù)分析資源應(yīng)用于大規(guī)模結(jié)直腸癌人群，不僅發(fā)現(xiàn)多種突變事件對預(yù)后的顯著預(yù)測效應(yīng)，新構(gòu)建的表達譜精細分型也將在未來指導(dǎo)結(jié)直腸癌個體化診療中發(fā)揮重要作用。期望未來能更加系統(tǒng)深入地解析不同腫瘤的發(fā)生發(fā)展機制，真正實現(xiàn)腫瘤的早診早治。(完)
